Exemple de mémoire pour le DEA d'Agronomie (méthodes d'analyses du transcriptome)

Biologie | 32 pages | 02-09-2008 | Format : | Note : Non noté |

PRIX : 9.00€ |

Résumé

Rapport bibliographique sur les méthodes d'analyse du transcriptome.

Extrait:

Pour mieux comprendre les relations entre génome et transcriptome, des études expérimentales sont entreprises pour produire des données d'expression. On cherche par ces expériences à réunir de grandes quantités d'informations sur les ARNm transcrits. Ces informations reflètent directement l'activité d'expression des gènes selon le tissu observé, le stade du développement, l'état normal ou pathologique des cellules (...)

Sommaire:

Introduction

I) La génomique fonctionnelle

II) L'étude de l'expression des gènes, analyse du transcriptome

A. Transcriptome
B. Intérêt des études de transcriptome

III) Les méthodes d'analyse du transcriptome

A. Les méthodes basées sur le séquençage
1. EST - Expressed Sequence Tag
2. La méthode SAGE (Serial Analysis of Genes Expression)
3. MPSS (Massively Parallel Signature Sequencing)

B. L'hybridation sur membrane, les puces à ADN
1. Les macropuces
2. Les micropuces à ADNc
3. Les micropuces à oligonucléotides
4. Les possibilités d'utilisation de puces d'ADN

C. Les techniques d'analyseur sur gel
1. La technique cDNA-AFLP (Amplified fragment Length Polymorphism)
2. Differentiel Display Reverse Transcription-PCR (DDRT-PCR)
3. RFLP-coupled DD (Restriction Fragments Length Polymorphism)
4. Screening differential de banques d'ADNc

IV) La comparaison des méthodes

Conclusion

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