Les matrices biologiques et leur rôle en bioinformatique

Biologie | 7 pages | 22-10-2007 | Format : | Note : Non noté

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Résumé

Qu'est-ce qu'une matrice en bioinformatique ? Ce document contient tout ce qu'il faut savoir sur les matrices Pam Blosum, très utilisées en Bioinfo (NCBI, GenBank...).

NB: document semi-rédigé.

Extrait:

En général la séquence détermine la structure (sauf dans le cas des fibres amyloïdes) et la structure détermine la fonction. En étudiant la similarité de séquences, on espère trouver une corrélation entre une séquence inconnue et des séquences ayant des propriétés structurales bien identifiées (ou fonctionnelles). Pour presque pas de similarité on peut trouver une structure qui aura une fonction proche ou identique (...)

Sommaire:

I) Les matrices nucléiques
II) Les matrices protéiques dérivées de l'évolution
III) Les matrices protéiques dérivées des structures 3D
IV) Les matrices protéiques fonction de l'environnement

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